Лаборатория иммунитета растений к болезням



     Руководитель - Афанасенко Ольга Сильвестровна,

     доктор биологических наук, академик РАН,

     тел.: (812) 470-43-84, доб. 212

     e-mail: plantresistance@vizr.spb.ru

 

  

 

Сотрудники лаборатории

Публикации сотрудников лаборатории (2011-2014) 


 

ДЕЯТЕЛЬНОСТЬ

 

Основные направления научных исследований:

  • Механизмы изменчивости популяций фитопатогенных грибов
  • Генетическое разнообразие устойчивости зерновых культур и картофеля к болезням
  • Генетика взаимоотношений в системе паразит-хозяин
  • Картирование генов устойчивости ячменя к гемибиотрофным патогенам
  • Биотехнология создания исходного материала для селекции ячменя на устойчивость к болезням
  • Устойчивость картофеля к карантинным болезням
  • Диагностика болезней зерновых культур

Основные объекты научных исследований:

  • Пшеница: Pyrenophora tritici-repentis, Puccinia graminis, Cochliobolus sativus
  • Ячмень: Pyrenophora teres f. teres, P. teres f. maculata, Cochliobolus sativus, Ramularia collo-cygni, Puccinia graminis
  • Картофель: Phytophtora infestans, Synchitrium endobioticum, Globodera rostochiensis, вирусные болезни

Исследования на договорной основе:

  • Оценка устойчивости сортов и образцов пшеницы и ячменя к болезням
  • Оценка  устойчивости  картофеля к карантинным болезням
  • Диагностика возбудителя рака картофеля в почвенных образцах
  • Диагностика золотистой картофельной нематоды  в почвенных образцах и растительном материале                 
  • Создание дигаплоидных линий ячменя методом культуры пыльников
  • Определение в сортах, коллекционных образцах и селекционном материале пшеницы известных генов устойчивости к возбудителям бурой и стеблевой ржавчины методами ПЦР  со специфическими праймерами

Также в лаборатории:

  • Работает школа по современным методам исследований иммунитета растений к болезням
  • Проводят стажировки по диагностике болезней, и современным методам изучения взаимоотношений в системе паразит-хозяин.

Текущие проекты:

Проект РФФИ 14-04-90039-бел-а (2014-2015). Молекулярно-генетическая структура популяций Pyrenophora teres из Беларуси и Северо-запада Европейской части России. Руководитель – Афанасенко О.С. Выполняется исследование направленности микроэволюционных процессов в популяциях возбудителя вредоносной болезни ячменя аскомицента Pyrenophora teres,  обитающих на Северо-западе Европейской части России и Беларуси. Планируется изучение популяций патогена из России и Беларуси по генотипическому составу, с использованием в качестве маркера признака вирулентности к почти изогенным линиям и молекулярных маркеров.  Результаты исследования позволят сравнить популяции P. teres f. teres из России и Беларуси,  определить уровень гетерогенности популяций,  интенсивность генного потока и дрейфа генов,  роль половой рекомбинации в изменчивости популяций, а также направление естественного отбора в зависимости от сортимента возделываемых ячменей.

Проект РФФИ 14-04-00399-а (2014-2016). Механизмы формирования популяций новых патогенов пшеницы и ячменя в связи с расширением их ареалов. Руководитель – Мироненко Н.В. Целью исследования является определение  распространения новых болезней злаковых культур на территории РФ (Ramularia collo-cygni и Pyrenophora teres f. maculatа) и исследование  генетической структуры географических (Северный Кавказ и Северо-Запад РФ) популяций Pyrenophora tritici-repentis и P. teres f. maculatа.

Проект РФФИ 14-04-00400-а (2014-2016). Идентификация генов, кодирующих устойчивость растений в патосистеме Hordeum vulgare - Pyrenophora teres f. Teres. Руководитель – Афанасенко О.С. Целью проекта является  идентификация и картирование генов, кодирующих устойчивость растений к возбудителю сетчатой пятнистости в  двух, созданных нами,  дигаплоидных популяциях ячменя. Проводится  фенотипирование по устойчивости к различным изолятам  Pyrenophora teres и генотипирование с использованием DArTseq маркеров.  

Проект РФФИ 15-54-12365 ННИО_а  (2015-2016) Ассоциативное картирование генетических детерминант устойчивости к возбудителям сетчатой и темно-бурой пятнистостей в наборе образцов Hordeum vulgare из центров генетического разнообразия ячменя (российско-немецкий прект). Руководитель – Афанасенко О.С.  Целью проекта является выявление генетического разнообразия устойчивости к Pyrenophora teres и Cochliobolus sativus в репрезентативной выборке коллекционных образцов ячменя методом ассоциативного картирования, с использованием ДНК-чип технологии (SNP-маркеры). В результате исследований будут выявлены новые доноры устойчивости ячменя к сетчатой и темно-бурой пятнистостям и проведено картирование QTL на хромосомах ячменя.

Недавно завершённые проекты:

Проект РФФИ 11-04-00877-а (2011-2013) Эволюционный потенциал патогенности и вирулентности возбудителей новых эпидемиологически опасных болезней пшеницы. Руководитель – Афанасенко О.С.  Выявлены закономерности формирования популяций Pyrenophora tritici-repentis на границе ареала патогена, определено распространение гена ТохА, контролирующего образование токсина некроза в географических популяциях возбудителя. В Краснодарском крае обнаружены 2 новые болезни ячменя – spot – форма возбудителя сетчатой пятнистости и рамуляриоз. Выявлено генетическое разнообразие устойчивости к угандийской расе стеблевой ржавчины коллекционных образцов и сортов пшеницы. 

Проект РФФИ 11-04-01105-а (2011-2013) Отбор по признаку вирулентности в популяциях карантинных возбудителей болезней картофеля Synchytrium endobioticum и Globodera rostochiensis под воздействием растений-хозяев с разным аллельным составом генов устойчивости. Руководитель - Мироненко Н. В. Показана  возможность отбора из популяции нематоды G.rostochiensis (Ro1) аллелей вирулентности к слабоустойчивым гибридам картофеля. Выявлены различные механизмы взаимодействия G. rostochiensis с  клонами картофеля.  Проведен молекулярный скрининг клонов картофеля на наличие доминантных аллелей известных генов устойчивости к G. rostochiensis патотипу Ro1 - H1 и Gro1.


 

ДОСТИЖЕНИЯ ПОСЛЕДНИХ ЛЕТ

 

Научные результаты:

  • Многолетние исследования позволили выявить особенности микроэволюционных процессов в популяциях гемибиотрофных патогенов ячменя: расообразовательные процессы связанные с рекомбинационными процессами, направление естественного отбора под влиянием генотипов растений-хозяев, распределение популяций P. teres и C. sativus в пространстве и во времени.
  • Создан международный набор сортов-дифференциаторов ячменя для анализа популяций возбудителя сетчатой пятнистости, который решением международной конференции по пятнистостям ячменя (Эдмонтон, Канада, 2006) принят к использованию на разных континентах.
  • Разработан комплекс методов исследования патосистемы пшеница - Pyrenophora tritici-repentis. Определена структура популяций возбудителя желтой пятнистости пшеницы по вирулентности и молекулярным маркерам, определены ареалы популяций патогена на европейской территории  РФ и Западной Сибири, направление изменчивости  по признаку вирулентности и образованию токсинов.
  • Созданы коллекции источников и доноров устойчивости ячменя, пшеницы и картофеля к болезням.
  • Разработана биотехнология создания исходного материала для селекции: создание дигаплоидных линий ячменя с различными генами устойчивости к гемибиотрофным патогенам
  • Созданы  картирующие популяции ячменя для картирования генов устойчивости;
  • Проведено молекулярное картирование новых генов и QTL, детерминирующих устойчивость к  P. teres f. teres P. teres f. maculata 
  • Изучено наследование признака авирулентности в мейотическом потомстве у фитопатогенных грибов Pyrenophora teres и Cochliobolus sativus.
  • Определен  характер взаимоотношений между генами устойчивости и авирулентности в двух патосистемах: Hordeum vulgare-Pyrenophora teres f. teres и Triticum aestivum- Cochliobolus sativus. Доказаны взаимоотношения генов по Флору (ген-на-ген).
  • Изучено распространение гена ToxA, кодирующего синтез токсина некроза - основного фактора патогенности P. tritici-repentis - в географически отдаленных популяциях патогена.
  • Обоснована стратегия селекции ячменя на устойчивость к болезням.
  • Выявлены новые для России патогены ячменя: Ramularia collo-cygni Pyrenophora teres f. maculata и новый хозяин - пшеница для P. teres f. teres.
  • Получен диплом РАСХН за лучшую завершенную научную разработку 2012 года "Листовые болезни пшеницы, методы изучения популяций их возбудителей и идентификации генов устойчивости к желтой пятнистости и бурой ржавчине"
  • Изданы каталоги устойчивых образцов растений (совместно с ВИР им. Н.И. Вавилова):
  • Каталог мировой коллекции ВИР. Ячмень. Характеристика сортов по выносливости к корневым гнилям и к сетчатой пятнистости, 1989
  • Каталог мировой коллекции ВИР. Вып. 684. Ячмень. Источники устойчивости к сетчатому гельминтоспориозу, видам головни, карликовой ржавчине, 1996.
  • Каталог мировой коллекции ВИР. Вып. 726. Озимая мягкая пшеница. СПб. 2000. Исходный материал для селекции на устойчивость к болезням в различных регионах России. 95 с.
  • Каталог государственных коллекций полезных и вредных организмов, 2001.
  • Каталог источников и доноров устойчивости  ячменя к листовым пятнистостям, 2013
  • Устойчивость видов  Triticum L. и Aegilops L. из коллекции ВИР к возбудителям желтой и темно-бурой листовых пятнистостей      
  • Устойчивость видов  Triticum L. и Aegilops L. из коллекции ВИР к возбудителям желтой и темно-бурой листовых пятнистостей (каталог). СПб. 2007. 60 с.
  • Генофонд устойчивости староместных пшениц  к бурой ржавчине, желтой и темно-бурой пятнистости, 2013.    

Созданы методические руководства:

  • Видоидентификация фитопатогенных грибов методом УП-ПЦР,  2003
  • Методы исследования структуры популяций возбудителя бурой ржавчины пшениц Puccinia recondita Rob. ex Desm. f.sp.tritici,  2002.
  • Видоидентификация фитопатогенных грибов методом УП-ПЦР, 2003
  • Желтая пятнистость пшеницы. Методические указания по изучению популяций возбудителя желтой пятнистости Pyrenophora trititci-repentis и устойчивости сортов, 2012. 56 с.
  • Принципы и методы создания доноров горизонтальной устойчивости картофеля к фитофторозу, 2001.
  • Сотрудничество с другими учреждениями Россельхозакадемии:
  • ВИР по оценке устойчивости коллекционного материала зерновых культур и картофеля к болезням и разработке MAS для селекции ячменя и картофеля на устойчивость к болезням.
  • КНИИСХ,  СибНИИСХ по созданию исходного материала для селекции сортов пшеницы устойчивых  к видам ржавчины и пятнистостям; по выявлению эффективных генов устойчивости против угандийской расы стеблевой ржавчины.
  • КНИИСХ, ЛНИИСХ, Архангельский НИИСХ, Всероссийский НИИ зерновых культур им. И.Г. Калиненко по оценке селекционного материала ячменя на устойчивость к болезням и созданию исходного материала для селекции.

Международное сотрудничество:

Осуществляется многолетнее сотрудничество с институтом изучения устойчивости и толерантности к стрессам Федерального центра по изучению культивируемых растений Германии (JKI Federal Research Centre for Cultivated Plants) и Центром сельскохозяйственных исследований Финляндии (MTT Agrifood Research Finland) по изучению генетического разнообразия ячменя к возбудителям пятнистостей листьев, межорганизменной генетике патосистем ячмень - гемибиотрофные патогены,  картированию генов устойчивости и созданию международного набора сортов-дифференциаторов для анализа популяций Pyrenophora teres Drechs. Сотрудничество с:

  • Миннесотским   государственным университетом США (University of Minnesota) по оценке устойчивости пшеницы и ячменя к расе стеблевой ржавчины Ug99;
  • Мэдисонским Университетом (США) по созданию коллекций источников и доноров устойчивости картофеля к фитофторозу;
  • Аделаидским университетом,  Университетом южного Квинсленда и Эрмитажной сельскохозяйственной станцией (Австралия) по проблеме молекулярного картирования генов устойчивости ячменя к болезням   и созданию международного набора сортов-дифференциаторов для анализа популяций Cochliobolus sativus
  • НПЦ по земледелию НАН Беларуси (Жодино) по  созданию изогенных линий ячменя для дифференциации популяций возбудителя сетчатой пятнистости, создании дигаплоидных популяций ячменя, анализу природных популяций патогенов:

 

ОСНАЩЕНИЕ

 

Оборудование:

Лаборатория оснащена современным оборудованием для исследований различными методами: классическими фитопатологическими (заражение растений фитопатогенными грибами) и микологическими (работа с чистыми культурами, световая микроскопия), и молекулярно-генетическими. Лаборатория использует также оборудование институтского ЦКП ИТЗР :

  • Термоциклер для амплификации нуклеиновых кислот в режиме реального времени в комплекте CFX, Bio-Rad;
  • Система документирования гелей ChemiDoc XRS PLUS, Bio-Rad;
  • Анализатор генетический (секвенатор ДНК) 3500 Genetic Analyzer, Applied Biosystems.
  • Электронный микроскоп
  • Микроскоп DM2500 с фотокамерой DFC320, Leica;
  • Климатические камеры КС-200, СКТБ и KBW 400, Binder;
  • Термоциклеры С1000, Bio-Rad "My Cycler"; оборудование для горизонтального и вертикального электрофореза.

Основные методы:

  • ПЦР - полимеразная цепная реакция с видоспецифичными праймерами;
  • Секвенирование продуктов амплификации
  • Рестрикция ДНК
  • Электрофоретическое разделение ДНК фрагментов в агарозных и полиакриламидных гелях
  • ИФА - иммуноферментный анализ;
  • Традиционные микологические методы (посев на питательные среды и микроскопический анализ);
  • Традиционные фитопатологические методы (инокуляция растений в лабораторных условиях);
  • Метод культуры пыльников ячменя

 

Почва

проведение микробиологического анализа почвы (на присутствие фитопатогенных (вредных) микроорганизмов и их количественный учет);

определение остаточных количеств пестицидов в почве;

Диагностика рака картофеля в почвенных образцах: Выезд и отбор проб для определения зараженности почвы карантинными болезнями картофеля;

Диагностика золотистой картофельной нематоды в почвенных образцах;

Идентификация фитопатогенных грибов, грибоподобных организмов, нематод, вредных и полезных насекомых, с помощью световой микроскопии;

Растительный материал

Проведение микробиологического анализа растительного материала (на присутствие фитопатогенных(вредных) микроорганизмов и их количественный учет)

Фитоэкспертиза растительного материала

Диагностика и определение степени зараженности картофеля болезнями в хранилище

Молекулярная диагностика возбудителей рака картофеля в растении

Диагностика золотистой картофельной нематоды в растительном материале

Идентификация фитопатогенных грибов, грибоподобных организмов, нематод, вредных и полезных насекомых, с помощью световой микроскопии;

Выявление фитопатогенных микроорганизмов в растительной ткани с помощью ПЦР с видоспецифичными праймерами;

Количественное определение токсинпродуцирующих грибов (Fusarium spp. и др.) в растительной ткани методом ПЦР в реальном времени;

Зерно и продукты переработки

Определение микологической и бактериальной зараженности хранящегося зерна злаковых и бобовых культур, а также продуктов их переработки в зернохранилищах промышленного типа и приспособленных в хозяйствах разных форм собственности

Анализ на содержание опасных микотоксинов в зерне и продуктах его переработки

Фитоэкспертиза семенного материала

Определение вредных насекомых в зерне и продуктах его переработки

Анализ на содержание семян сорных растений в семенном материале, кормах (зерноокорм)

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Пестициды (биологические и химические)

Комплекс аналитических исследований по определению качества препаратов, их соответствия ТУ завода - изготовителя

Испытание средств механизации

Испытание распылительных насадок для внесения средств защиты растений

Аналитика, прогнозы

Консультации о развитии и распространении доминантных видов вредных организмов с учетом агрометеорологических данных с прогнозом численности и вредоносности и рекомендациями по проведению защитных мероприятий

Услуги по определению доминантных видов вредителей по имаго и повреждениям растений (визуально и с помощью инструментальных методов):

на зерновых культурах – вредная черепашка, австрийский клоп, маврский клоп, элии, злаковые тли, красногрудая пьявица, ячменная и овсяная шведские мухи, гессенская муха, обыкновенный и черный хлебные пилильщики, хлебная жужелица, хлебные жуки (жук-кузька, жук-красуля, жук-крестоносец), обыкновенная и восклицательная зерновые совки, цикадки;

на кукурузе – кукурузный мотылек, хлопковая и озимая совка, тли, цикадки; крестоцветные культуры – весенняя и летняя капустные мухи, крестоцветные блошки, капустная моль, капустная и репная белянки, капустная тля, капустная совка, капустный скрытнохоботник;

на картофеле – колорадский жук, картофельная коровка, картофельная моль, тли.

Составление технологических карт хозяйств

Диагностика вредителей, болезней и сорняков

Консультативная и методическая помощь специалистам по защите растений и агрономам по защите зерновых, овощных культур и картофеля

Фитосанитарный мониторинг

Услуги систематического мониторинга сельскохозяйственных угодий в целях прогнозирования фитосанитарной ситуации (на каждом конкретном поле) для установления экономической целесообразности проведения химической борьбы с вредными организмами или отмены химических обработок

Услуги дистанционного гиперспектрального фитосанитарного зондирования агроландшафтов и агроэкосистем

Оценка фитосанитарного состояния посевов и посадок сельскохозяйственных культур

Диагностика и мониторинг болезней картофеля в полевых условиях

Биоценологическая оценка применяемых методов и средств защиты растений в хозяйствах

Разработка критериев и системы принятия решений о проведении защитных мероприятий для конкретного объекта и хозяйства

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Определение потерь урожая от комплекса вредных видов для конкретного хозяйства

Разработка систем и технологий защиты полевых культур от комплекса вредных видов для конкретного хозяйства

Услуги по разработке и внедрению интегрированной экологически малоопасной системы защиты цветочных, декоративных и овощных культур от вредителей и возбудителей болезней в теплицах

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

2Определение опасных фитофагов и мерам борьбы с вредителями на различных с.х. культурах.

Биологическая защита

Консультации по вопросам, связанным с использованием биопрепаратов против вредных насекомых

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Консультации по вопросам биологических методов подавления адвентивной сорной растительности

Услуги по разработке зональных систем биологизированной защиты зерновых колосовых, овощных культур, кукурузы и сои от доминантных вредителей с антирезистентной направленностью

Услуги по разработке агротехнологии беспестицидной защиты зерновых колосовых культур от вредной черепашки и других хлебных клопов на основе расширенного воспроизводства энтомофагов и их дополнительного хозяина в природных экосистемах

Услуги по разработке и внедрению экологизированной системы защиты сада

Услуги по разработке и внедрению экологизированной системы защиты овощных культур

Услуги по подбору ассортимента микробиологических препаратов для защиты сельскохозяйственных культур от фитопатогенов, включая возможность их интеграции с химическими и другими средствами защиты растений

Оказание консультационных услуг по применению феромонных материалов в защите растений

Услуги биологического контроля вредителей культур защищенного и открытого грунта с элементами применения энтомофагов

2Оказание консультационных услуг по вопросам производства энтомофагов

Химическая защита

Разработка систем и технологий защиты полевых культур от комплекса вредных видов

Услуги по оптимизации ассортимента средств борьбы с сорной растительностью в конкретных условиях ведения с.х. производства

Услуги по определению резистентности у насекомых, возбудителей заболеваний, сорных трав к пестицидам

Услуги по разработке технологий повышения продуктивности и качества основных с.х. культур: озимая пшеница, подсолнечник, сахарная свекла с использованием композиций сниженных доз химических средств защиты растений, регуляторов роста и иммуностимуляторов

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Услуги диагностики и выполнение работ по снижению негативного воздействия и последствия гербицидов на чувствительные с.х. культуры

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Консультационные услуги по подбору пестицидов исходя из их эффективности к имеющимся в хозяйстве вредным объектам.

Консультации по применению пестицидов на посевах основных с.х. культур

Другое:

Сорта и гибриды

Услуги по подбору и рекомендации по закупке сортов и гибридов по их устойчивости к болезням, вредителям и пестицидам

Услуги подбора оптимальных сортов сельскохозяйственных культур для выращивания по экологически малоопасным технологиям;

Испытания и регистрация

Изучение последействия гербицидов на последующие культуры севооборота

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Оценка активности, спектра действия новых гербицидов и степени устойчивости к ним с.х. культур

Оценка активности, спектра действия новых фунгицидов и степени устойчивости к ним возбудителей заболеваний с.х. культур

Оценка активности, спектра действия новых инсектицидов и степени устойчивости к ним возбудителей заболеваний с.х. культур

Оценка микроорганизмов на фитотоксичность и патогенность к различным сельскохозяйственным культурам

Проведение регистрационных испытаний фунгицидов, инсектицидов, гербицидов, родентицидов, регуляторов роста растений и иммуностимуляторов

Демонстрационные испытания пестицидов

Испытания феромонных ловушек

Инновационные технологии производства и применения малоопасных биопестицидов биогенного происхождения

Изготовление образцов технических средств опрыскивания и протравливания семенного материала, диагностики и фитосанитарного мониторинга

Разработка технологий фитобиоремедиации почв, загрязненных углеводородами

Разработка технологий лабораторного производства биопрепаратов

Патент «Способ биологической защиты тепличных культур от тлей»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости злаков к насекомым, повреждающим зерно»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения поврежденности зерна и муки пшеницы вредителями»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости кукурузы к стеблевому мотыльку»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости кукурузы к грызущим вредителям»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости пшеницы к вредной черепашке»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости капусты к капустным мухам»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ сортовой идентификации пшеницы»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости кукурузы к вредителям»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости злаков к вредной черепашке»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости злаков к вредной черепашке»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости капусты к капустной тле»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ оценки скороспелости генотипов кукурузы»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ идентификации ингибиторов гидролаз»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости ячменя к Oscinella pusilla Meig.»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ оценки устойчивости риса к прибрежной мухе»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ диагностики физиологической устойчивости кукурузы к шведской мухе»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ диагностики поврежденности зерна пшеницы сосущими вредителями»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости растений огурца к тепличной белокрылке и паутинному клещу»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Патент «Способ определения устойчивости растений огурца к паутинному клещу»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Электронный справочник «Сорные растения вашего хозяйства и меры борьбы с ними в разных культурах»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Справочник гербария «Сорные растения вашего хозяйства на разных стадиях развития»

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Определение совместимости микробиологических препаратов, в т.ч. с химическими и другими средствами защиты растений, с целью применения их в сложных композиционных составов для протравливания семян и обработки вегетирующих растений от комплекса вредителей и болезней»

Консультации по рациональному размещению полевых и многолетних культур в зависимости от типовых особенностей почвенного покрова агроландшафтов.

Выделение, идентификация, скрининг, селекция

Характеристика популяций возбудителей болезней по различным маркерам (вирулентность, ДНК – полиморфизм, резистентность к фунгицидам и др.)

Устойчивость сортов и образцов ячменя к возбудителям:

Сетчатой пятнистости

Темно-бурой пятнистости

Оценка устойчивости сортов и образцов пшеницы к возбудителям

Оценка устойчивости сортов и образцов картофеля к фитофторозу

Оценка устойчивости сортов и образцов картофеля к карантинным объектам:

Предварительная оценка сортов и образцов картофеля на устойчивость к раку картофеля

Предварительная оценка сортов и образцов картофеля на устойчивость к золотистой картофельной нематоде

Создание дигаплоидных линий ячменя методом культуры пыльников

Определение в сортах, коллекционных образцах и селекционном материале пшеницы известных генов устойчивости к возбудителям бурой и стеблевой ржавчины методами ПЦР со специфическими праймерами

Изучение генофонда устойчивости растения – хозяина (типы устойчивости, генетика устойчивости сортообразцов, источники устойчивости, в т.ч. групповой) на искусственных инфекционных фонах и приемов сохранения и продления устойчивости

Источники устойчивости сельскохозяйственных культур к комплексу болезней

Поиск сортообразцов различных с.х.культур, устойчивых к болезням и вредителям

Демонстрационные испытания сортов и гибридов

Услуги по оценке на устойчивость к вредителям (полевыми и лабораторными методами) сортов, гибридов сельскохозяйственных культур, коллекционного и селекционного материала для совершенствования селекционных программ и для включения в зональные системы интегрированной защиты:

- для зерновых культур – к шведским мухам, к гессенской мухе, вредной черепашке, злаковым тлям, красногрудой пьявице, хлебным пилильщикам;

- для картофеля и других пасленовых культур – к колорадскому жуку, к картофельной коровке, к картофельной моли;

- для капусты и крестоцветных корнеплодов – к комплексу вредителей (капустные мухи, крестоцветные блошки, капустная моль, репная и капустная белянки, капустная тля);

моркови – к морковной мухе и морковной листоблошке;

- для огурца – к паутинному клещу, табачному трипсу, бахчевой тле и тепличной белокрылке в защищенном грунте;

- для черной смородины – к смородиновому почковому клещу и реверсии

фотосъемка биологических объектов

Электронная микроскопия:

Без напыления

Заморозка

Влажная камера

С напылением

Идентификация фитопатогенных грибов, Грибоподобных организмов, нематод, вредных и полезных насекомых, с помощью световой микроскопии

Экстракция тотальной ДНК из природных образцов

Амплификация и клонирование таксономически значимых участков рибосомального оперона (гены субъединиц хромосомы, межгенные области)

Определение нуклеотидных последовательностей (секвенирование) ДНК

Таксономический, филогенетический и кластерный анализ нуклеотидных последовательностей ДНК

Предоставление эталонных культур фитопатогенных грибов для целей видовой идентификации

Количественное определение токсинпродуцирующих грибов (Fusarium spp. и др.) в растительной ткани методом ПЦР в реальном времени;

Приготовление стандартных растворов ДНК видов Fusarium и Alternaria для количественной ПЦР в реальном времени

Определение биологической активности (фитотоксической, антибиотической, фунгицидной, инсектицидной, зоотоксической) экстрактов из микроорганизмов и их метаболитов (индивидуальных соединений);

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Выявление степени контаминации зерна микотоксинами (дезоксиниваленол, Т-2 токсин, зеараленон) методом ИФА

Выявление способности грибов рода Fusarium продуцировать микотоксины (дезоксиниваленол, Т-2 токсин) методом ИФА

Идентификация генов устойчивости пшеницы к бурой ржавчине с использованием ДНК-маркеров

Качественный и количественный анализ многокомпонентных смесей методом высокоэффективной тонкослойной хроматографии

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Аналитическое и препаративное разделение сложных смесей химических соединений с помощью жидкостной хроматографии

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Препаративное выделение биологически активных соединений микроорганизмов и их первичная идентификация

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Разработка методов анализа биологически активных соединений микроорганизмов при помощи тонкослойной и высокоэффективной жидкостной хроматографии

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Определение биологической активности (фитотоксической, антибиотической, фунгицидной, инсектицидной, зоотоксической) экстрактов из микроорганизмов и их метаболитов (индивидуальных соединений)

Разработка методов анализа биологически активных соединений микроорганизмов при помощи тонкослойной и высокоэффективной жидкостной хромотографии

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Проведение хемотаксономических исследований на основ сравнения метаболитных профилей микроорганизмов

Экстракция ДНК и РНК различных микроорганизмов

Клонирование полноразмерных копий генов и их фрагментов

Синтез безинтронной копии гена в виде кДНК с последующей ПЦР-амплификацией и клонированием белок-кодирующей последовательности

Создание молекулярно-генетических конструкций и подбор условий для экспрессии и наработки рекомбинантных белков в бактериях E.coli и метилотрофных дрожжах P.pastoris

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Подбор условий эффективной экспрессии и наработки рекомбинантных продуктов в гетерологичных системах

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Подбор системы и оптимизация условий экспрессии для получения целевого белка в активном, растворимом состоянии

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Разработка схем выделения и очистки рекомбинантных продуктов

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Получение поликлональных антител к антигенам заказчика в мышах и кроликах с последующей иммуноаффинной очисткой специфических иммуноглобулинов

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Иммунохимический анализ белков с помощью методов иммуноблотинга и иммунофлюоресцентной микроскопии

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Иммобилизация белков, включая антитела, на BrCN-активированной сефарозе

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Разработка индивидуальных схем очиски белков с помощью методов хроматографии и препаративного гель – электрофореза

Подбор олигонуклеотидных праймеров заданной специфичности дл ПЦР

Анализ содержания общего белка и отдельных белковых фракций (включая концентрирование) с помощью колориметрических и электрофоретических методов

Выявление энтомопатогенных микроорганизмов с помощью ПЦР с высокоспецифическими праймерами

Обеспечение энтомофагами с.х. предприятий

Обеспечение стартовыми и маточными популяциями энтомофагов из государственной коллекции, поддерживающейся в институте

Наработка биоматериала при помощи твердофазной и жидкофазной ферментации для выделения и анализа метаболитов микроорганизмов

Разработка методов получения инфекционного материала и его хранения с целью создания искусственного инфекционного фона или микогербицидов

Проведение научных конференций, практических семинаров по болезням, вредителям и сорным травам по различным сельхозкультурам

Проведения курсов повышения квалификации для агрономов по защите

Проведение стажировок по современным методам идентификации грибов и диагностики болезней растений;

Проведение стажировки «Использование молекулярных маркеров для оценки генетического разнообразия мягкой пшеницы по устойчивости к бурой и стеблевой ржавчинам и полиморфизма популяций гриба Puccinia triticina»;

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Проведение стажировки «Современные методы исследований иммунитета растений к болезням».

Школа по молекулярной диагностике генетических детерминант устойчивости зерновых культур к болезням

Школа по диагностике, мониторингу и СЗР от сорных трав

  • Лаборатории, предоставляющие данную услугу

Школа по современным методам фитосанитарного мониторинга и прогноза